Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms