Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms