Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y512

SAMM50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMM50Q9Y512 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAMM50Q9Y512 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SAMM50Q9Y512 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SAMM50Q9Y512 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SAMM50Q9Y512 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SAMM50Q9Y512 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SAMM50Q9Y512 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMM50Q9Y512 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms