Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms