Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KIF3AQ9Y496 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms