Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms