Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNIP3Q9Y2W7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms