Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LEMD3Q9Y2U8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LEMD3Q9Y2U8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LEMD3Q9Y2U8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LEMD3Q9Y2U8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LEMD3Q9Y2U8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LEMD3Q9Y2U8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LEMD3Q9Y2U8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LEMD3Q9Y2U8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LEMD3Q9Y2U8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LEMD3Q9Y2U8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LEMD3Q9Y2U8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LEMD3Q9Y2U8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LEMD3Q9Y2U8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LEMD3Q9Y2U8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LEMD3Q9Y2U8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LEMD3Q9Y2U8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LEMD3Q9Y2U8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LEMD3Q9Y2U8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LEMD3Q9Y2U8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LEMD3Q9Y2U8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LEMD3Q9Y2U8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LEMD3Q9Y2U8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LEMD3Q9Y2U8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LEMD3Q9Y2U8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LEMD3Q9Y2U8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms