Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NINLQ9Y2I6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NINLQ9Y2I6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NINLQ9Y2I6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NINLQ9Y2I6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NINLQ9Y2I6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NINLQ9Y2I6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NINLQ9Y2I6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NINLQ9Y2I6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NINLQ9Y2I6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NINLQ9Y2I6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NINLQ9Y2I6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NINLQ9Y2I6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NINLQ9Y2I6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NINLQ9Y2I6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NINLQ9Y2I6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NINLQ9Y2I6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NINLQ9Y2I6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NINLQ9Y2I6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NINLQ9Y2I6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NINLQ9Y2I6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NINLQ9Y2I6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NINLQ9Y2I6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NINLQ9Y2I6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NINLQ9Y2I6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NINLQ9Y2I6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NINLQ9Y2I6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms