Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHKBQ9Y259 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms