Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POMPQ9Y244 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms