Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms