Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX7Q9UNH6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms