Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms