Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PALD1Q9ULE6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PALD1Q9ULE6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms