Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MRTO4Q9UKD2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms