Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKB1

FBXW11, F-box/WD repeat-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW11Q9UKB1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FBXW11Q9UKB1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXW11Q9UKB1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXW11Q9UKB1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXW11Q9UKB1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXW11Q9UKB1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXW11Q9UKB1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXW11Q9UKB1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXW11Q9UKB1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXW11Q9UKB1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXW11Q9UKB1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXW11Q9UKB1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXW11Q9UKB1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXW11Q9UKB1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXW11Q9UKB1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXW11Q9UKB1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXW11Q9UKB1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXW11Q9UKB1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXW11Q9UKB1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXW11Q9UKB1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXW11Q9UKB1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms