Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCNL1Q9UK58 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCNL1Q9UK58 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCNL1Q9UK58 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNL1Q9UK58 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNL1Q9UK58 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNL1Q9UK58 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNL1Q9UK58 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNL1Q9UK58 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNL1Q9UK58 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNL1Q9UK58 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNL1Q9UK58 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNL1Q9UK58 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNL1Q9UK58 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNL1Q9UK58 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNL1Q9UK58 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNL1Q9UK58 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNL1Q9UK58 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNL1Q9UK58 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNL1Q9UK58 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNL1Q9UK58 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNL1Q9UK58 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNL1Q9UK58 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNL1Q9UK58 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNL1Q9UK58 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNL1Q9UK58 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNL1Q9UK58 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCNL1Q9UK58 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCNL1Q9UK58 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms