Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SALL4Q9UJQ4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms