Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms