Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP25Q9UHP3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP25Q9UHP3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms