Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FBXO40Q9UH90 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms