Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms