Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PEF1Q9UBV8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms