Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms