Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms