Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J5

LARS, Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARSQ9P2J5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LARSQ9P2J5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms