Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
USP35Q9P2H5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
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