Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms