Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALCOCO1Q9P1Z2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms