Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMG20BQ9P0W2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms