Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms