Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP1Q9NZU7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP1Q9NZU7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms