Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSD3Q9NYI0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSD3Q9NYI0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSD3Q9NYI0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSD3Q9NYI0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSD3Q9NYI0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSD3Q9NYI0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSD3Q9NYI0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSD3Q9NYI0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSD3Q9NYI0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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