Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXC10Q9NYD6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms