Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA8Q9NY65 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms