Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ARHGEF38Q9NXL2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF38Q9NXL2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms