Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX00

TMEM160, Transmembrane protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM160Q9NX00 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM160Q9NX00 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM160Q9NX00 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM160Q9NX00 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM160Q9NX00 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM160Q9NX00 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM160Q9NX00 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM160Q9NX00 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM160Q9NX00 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM160Q9NX00 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM160Q9NX00 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM160Q9NX00 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM160Q9NX00 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms