Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATAD3AQ9NVI7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms