Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARVAQ9NVD7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PARVAQ9NVD7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARVAQ9NVD7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARVAQ9NVD7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARVAQ9NVD7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARVAQ9NVD7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARVAQ9NVD7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARVAQ9NVD7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARVAQ9NVD7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARVAQ9NVD7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVAQ9NVD7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVAQ9NVD7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVAQ9NVD7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVAQ9NVD7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVAQ9NVD7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVAQ9NVD7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVAQ9NVD7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVAQ9NVD7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVAQ9NVD7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVAQ9NVD7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVAQ9NVD7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVAQ9NVD7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVAQ9NVD7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARVAQ9NVD7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms