Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms