Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDREJQ9NTG1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDREJQ9NTG1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms