Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT84Q9NSB2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT84Q9NSB2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT84Q9NSB2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT84Q9NSB2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT84Q9NSB2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT84Q9NSB2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT84Q9NSB2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT84Q9NSB2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT84Q9NSB2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT84Q9NSB2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT84Q9NSB2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT84Q9NSB2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT84Q9NSB2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT84Q9NSB2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT84Q9NSB2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KRT84Q9NSB2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms