Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF19Q9NS68 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms