Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMPRSS4Q9NRS4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS4Q9NRS4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms