Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUOX1Q9NRD9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms