Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR97

TLR8, Toll-like receptor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR8Q9NR97 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR8Q9NR97 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms