Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
RTN4Q9NQC3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms