Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA4BQ9NPR2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA4BQ9NPR2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA4BQ9NPR2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA4BQ9NPR2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA4BQ9NPR2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA4BQ9NPR2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA4BQ9NPR2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA4BQ9NPR2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA4BQ9NPR2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA4BQ9NPR2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA4BQ9NPR2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA4BQ9NPR2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA4BQ9NPR2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA4BQ9NPR2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SEMA4BQ9NPR2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SEMA4BQ9NPR2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms