Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3GQ9HC16 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms